目前市府已建置「外縣市役男申請臺南市代辦體檢線上預約系統」（網址：http://tnda.tncg.gov.tw/day/），役男直接上網站，選擇自己可以配合的場次、醫院進行預約即可。預約完成後，並電話告知戶籍地兵役單位代檢日期及代檢醫院。